| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 楠元 裕也(2) | 藤蔭高校 | 2'38"34 | |
| 2 | 中島 巨翔(3) | 藤蔭高校 | 2'41"12 | |
| 3 | 後藤 航大 | ちけずきっちん | 2'42"21 | |
| 4 | 原田 紳助(2) | 藤蔭高校 | 2'45"12 | |
| 5 | 松永 瑠慕(2) | 藤蔭高校 | 2'48"04 | |
| 6 | 田島 拓弥(1) | 藤蔭高校 | 2'48"28 | |
| 7 | 後藤 司(2) | 藤蔭高校 | 2'52"35 | |
| 8 | 阿南慶志郎(2) | 藤蔭高校 | 2'55"97 | |
| 9 | 穴井 優希 | 大分県 | 2'57"79 | |
| 10 | 徳永 拓真 | 大分陸協 | 2'58"05 | |
| 11 | 徳永 昇生(1) | 大分西中学 | 2'58"44 |