| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 宇佐 奏太(2) | 藤蔭高校 | 2'36"62 | |
| 2 | 楠元 裕也(3) | 藤蔭高校 | 2'39"94 | |
| 3 | 山本 隆矢(3) | 藤蔭高校 | 2'43"43 | |
| 4 | 原田 紳助(3) | 藤蔭高校 | 2'43"66 | |
| 5 | 高倉 宗嗣 | 大分大 | 2'44"92 | |
| 6 | 櫻井 駿 | 大分陸協 | 2'45"23 | |
| 7 | 松永 瑠慕(3) | 藤蔭高校 | 2'45"51 | |
| 8 | 後藤 司(3) | 藤蔭高校 | 2'45"64 | |
| 9 | 大蔵 一樹(2) | 藤蔭高校 | 2'47"41 | |
| 10 | 徳永 昇生(2) | 大分西中 | 2'49"90 | |
| 11 | 徳永 拓真 | 大分陸協 | 2'51"97 | |
| 12 | 穴井 優希(2) | 大在中学校 | 3'12"54 | |
| 13 | 薬師寺咲月(2) | 体力学校 | 3'32"26 | |
| 14 | 河原 章 | 大分県 | 4'24"87 | |
| 15 | 森 幾子 | TRISE | 4'45"26 | |
| 田島 拓弥(2) | 藤蔭高校 | 欠場 |