| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 川村 理人(3) | 滝尾中学校 | 4'38"85 | |
| 2 | 工藤 俊昌 | 由布市陸協 | 4'45"40 | |
| 3 | 田中 秀貴 | 農業大学校 | 4'48"11 | |
| 4 | 穴井 優希(2) | 大在中学校 | 4'55"08 | |
| 5 | 有馬 義信 | 農業大学校 | 5'06"17 | |
| 6 | 江藤 輝幸 | 輝Athlete Club | 5'07"80 | |
| 7 | 伊藤 匠 | 農業大学校 | 5'20"75 | |
| 8 | 重清 史也(1) | 鶴崎中学校 | 5'22"86 | |
| 9 | 中野 真希 | 農業大学校 | 5'34"78 | |
| 10 | 船岡 洋 | 兵庫県 | 5'42"89 | |
| 11 | 江頭 郁代 | 大分陸協 | 6'05"40 |