| 順位 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 東條 吏起 | 日本文理大学 | 2'34"17 | |
| 2 | 入口 汰地 | 日本文理大学 | 2'37"15 | |
| 3 | 樋口 翔太 | 大分東明高校 | 2'42"18 | |
| 4 | 平野 遥斗 | 大分東明高校 | 2'43"20 | |
| 5 | 青松 昊汰 | 大分東明高校 | 2'45"48 | |
| 6 | 末永 倫輝 | 大分東明高校 | 2'46"44 | |
| 7 | 土谷 春樹 | 大分東明高校 | 2'46"46 | |
| 8 | 徳永 拓真 | とくなが整骨院 | 2'47"74 | |
| 9 | 奥本 勝海 | 大分東明高校 | 2'49"02 | |
| 10 | 藤井 和人 | 大分東明高校 | 2'50"65 | |
| 11 | 岡本 凌弥 | 大分東明高校 | 2'51"71 | |
| 12 | 寺尾 雄大 | 大分東明高校 | 2'52"36 | |
| 13 | 穴井 光希 | 大分東明高校 | 2'52"78 | |
| 14 | 渡邊 理人 | 大分東明高校 | 2'53"37 | |
| 15 | 末吉 優太 | 大分東明高校 | 2'53"87 | |
| 16 | 岡田 昂明 | 大分東明高校 | 2'54"13 | |
| 17 | 津田 航輝 | 大分東明高校 | 2'55"32 | |
| 18 | 石田 吏桜 | 大分東明高校 | 2'55"48 | |
| 19 | 河野 竜 | 大分東明高校 | 2'59"95 | |
| 20 | 槐島 光莉 | 日本文理大学 | 3'09"12 | |
| 21 | 江頭 郁代 | チームえがりっ | 3'52"82 | |
| 22 | 河原 章 | 大分県 | 4'23"89 | |
| 徳永 昇生 | とくなが整骨院 | 欠場 |